Assassin's Creed Shadows hat seit seiner Veröffentlichung begeisterte Kritiken erhalten. Die Veröffentlichung des Spiels liegt noch in weiter Ferne, aber viele haben sich bereits ihre eigene Meinung über das Spiel gebildet.

Die Hauptquelle der Kontroverse ist Ubisofts Versuch, die dunkelhäutige Hauptfigur Yasuke als einen bewährten Samurai im Westen zu vermarkten, obwohl es keine glaubwürdigen historischen Beweise aus dieser Zeit gibt, die belegen, dass der aus der Sklaverei stammende Mann tatsächlich ein Samurai und nicht nur ein Leibwächter war. Die Auswirkungen der Tatsache, dass zum ersten Mal in der Geschichte der Assassin's-Creed-Spiele eine der Hauptfiguren im Spiel keine einheimische Figur aus dieser Ära ist, sondern ein Ausländer, der einige Jahre in Japan gelebt hat, auf die Verkaufszahlen sind noch fraglich, aber es gibt auch Probleme rund um das Spiel, die aufgrund von Ubisofts Fehlern echte rechtliche Konsequenzen haben könnten.

Die kanadischen Mitarbeiter von Ubisoft haben sicherlich eine Menge Nachforschungen über das Zeitalter angestellt, auch wenn der Schwerpunkt wohl eher auf der politisch korrekten Auslegung der konfuzianischen Lehren und dem ständigen Umschreiben von Wikipedia-Seiten lag, als auf der Überprüfung der verwendeten Grafiken. Ubisoft begann damit, die Flagge einer freiwilligen Traditionalistengruppe ohne Erlaubnis auf mehreren Konzeptzeichnungen und der Sammleredition des Spiels zu verwenden.

Das Traditionalisten-Team, das die Flagge verwendet hatte, kündigte sofort an, rechtliche Schritte gegen Ubisoft einzuleiten, aber es scheint, dass es ihnen gelungen ist, die Angelegenheit im Laufe der Zeit beizulegen, denn Ubisoft hat sich öffentlich für die unerlaubte Verwendung der Flagge entschuldigt.

Ubisoft wird die Flagge in Zukunft nicht mehr verwenden, kann sie aber auch nicht aus der Sammlerausgabe des Buches entfernen.

Ubisoft hat bei den Marketingmaterialien für Shadows mehrere Fehler gemacht. Sie haben das Logo der falschen Familie auf die Statue der Sammleredition geklebt, aber sie haben auch die falschen Süßigkeiten auf die Geschenkbox für die Inhaltsproduzenten geklebt.